超声波应用于金属材料的焊接，虽然可以获得良好的焊接效果。而整个系统的超声波发生器和声学系统与机械系统相结合。在稳定性、可操作性和可靠性方面还存在一些问题。因此，声学系统(换能器、喇叭、连接部件)的设计，以及声学系统与试件的连接等都是非常关键的问题。
对金属超声焊接机理认识不足。超声波金属焊接中是否有金属熔化现象。它只是一种固相焊接方法，或金属之间的“粘接”过程，需要进一步研究。
超声波金属焊接工艺参数的影响因素很多，不易总结。
由于焊接所需的功率随工件厚度和硬度的增加呈指数级增加，因此大功率超声波焊接机制造难度大，成本高。随着焊接功率的进一步增加。在声学系统的设计和制造中不仅会面临一系列更加困难的问题，而且可能无法达到预期的工艺结果。因此，它目前限于薄的部件，如焊丝、箔和薄板。
超声波焊接机的“开放性”比较差，工件的投影尺寸不能超过焊接系统的允许范围。目前接头的形式限于搭接。
焊点表面易发生高频机械振动，可能对边缘造成疲劳损伤。对硬脆材料焊接不佳。
目前超声波焊接的焊接质量检测比较困难。无损检测设备尚未普及。普通方法不能用于监控。这也给批量生产造成了一定的困难。
